Verfahren

Nachweis von RNA/DNA

Indikation

• Blutstrominfektionen
• Bakteriämien (gegebenenfalls ausgehend von intravas­kulären Fremdkörpern)

Material

Blutkultur

Methode

Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Grampositive bakterielle Pathogene

• Enterococcus faecalis/faecium
• Listeria monocytogenes
• Staphylococcusspp. (S. aureus, S. epidermidis, S. lugdunensis)
• Streptococcusspp. (S. agalactiae, S. pneumoniae, S. pyogenes)

Gramnegative bakterielle Pathogene

• Acinetobacter calcoaceticus-baumanii complex
• Bacteroides fragilis
• Enterobacterales (Enterobacter cloacae complex, Escherichia coli, Klebsiella aerogenes, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae group, Proteus spp., Salmonella spp., Serratia marcescens)
• Haemophilus influenzae
• Neisseria meningitidis
• Pseudominas aeruginosa
• Stenotrophomonas maltophilia

Pilz-Pathogene

• Candida spp. (C. albicans, C. auris, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis)
• Cryptococcus neoformans/gattii

Zusätzlich können bestimmte Resistenzgene nachgewiesen werden.

Es besteht weiterhin die Möglichkeit, mit diesem Multiplex-Panel auch andere Nativmaterialien, wie z. B.

• Herzklappengewebe,
• Gelenkpunktate oder
• Shunt-Liquores

außerhalb des akkreditierten Laborbereiches zu untersuchen.

Verfahren

Nachweis von RNA/DNA

Indikation

Gastroenteritis

Material

Stuhl

Methode

Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren

Lauris-
Auftragserteilung

PCR

• Multiplex PCR-Gastroenteritisviren → Multiplex-Gastroenteritis Viren PCR (Panel 1)
• Multiplex PCR-Gastroenteritisviren → Multiplex-Gastroenteritis Bakterien PCR (Panel 2)
• Multiplex PCR-Gastroenteritisviren → Multiplex-Gastroenteritis Bakterien PCR (Panel 3)
• Multiplex PCR-Gastroenteritisviren → Multiplex-Gastroenteritis einzellige Parasiten PCR (Panel 4)

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Gastroenterotrope Viren (Panel 1)

• Norovirus Genogruppe 1
• Norovirus Genogruppe 2
• Adenovirus
• Rotavirus
• Astrovirus
• Sapovirus

Gastroenterotrope Bakterien (Panel 2)

• Campylobacter spp.
• Clostridioides difficile Toxin A/B
• Salmonella spp.
• Shigella spp. / EIEC
• Vibrio spp.
• Yersinia enterocolitica
• Aeromonas spp.

Gastroenterotrope Bakterien (Panel 3)

• C. difficile Ribotyp O27
• Escherichia coli O157
• STEC (Shigatoxin bildende Escherichia coli,  stx 1/2)
• EPEC (Enteropathogene Escherichia coli, eaeA)
• ETEC (Enterotoxische Escherichia coli, lt/st)
• EAEC (Enteroaggregative Escherichia coli, aggR)

Gastroenterotrope Parasiten (Panel 4)

• Giardia lamblia
• Entamoeba histolytica
• Cryptosporidium spp.
• Blastocystis hominis
• Dientamoeba fragilis
• Cyclospora cayatenensis

Bei positivem PCR-Nachweis von Erregern aus dem Panel 2 (außer Clostridioides difficile-Toxin) wird eine kulturelle Erregeranzucht für eine phänotypische Resistenztestung durchgeführt.

Verfahren

Nachweis von RNA/DNA

Indikation

Material

• Nasen-, Rachenabstrich
• Sputum
• Tracheo-/Bronchialsekrete, BAL

Methode

Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren

Lauris-
Auftragserteilung

PCR

PCR → PCR → Multiplex-PCR Respiratorische Pathogene → bei ambulant erworbener Pneumonie

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Virale respiratorische Pathogene

• Adenovirus
• Bocavirus
• Coronavirus (NL63, 229E, OC43)
• Enterovirus
• Humanes Metapneumovirus
• Humanes Rhinovirus
• Influenza A Virus (H1, H1pdm09, H3)
• Influenza B Virus
• Parainfluenzavirus (1, 2, 3, 4)
• Respiratorisches Synzytialvirus (RSV A, B)

Bakterielle respiratorische Pathogene

• Bordetella parapertussis
• Bordetella pertussis
• Chlamydia pneumoniae
• Legionella pneumophila
• Haemophilus influenzae
• Mycoplasmoides pneumoniae
• Streptococcus pneumoniae

Die Beurteilung der ätiologischen Relevanz, insbesondere bei Nachweis mehrerer Erreger, ist in Zusammenschau mit klinischen und paraklinischen Parametern zu treffen.

Besiedlungen ohne Indikation für eine Therapie, z. B. mit  Pneumokokken- und/oder Haemophilus influenzae-Isolaten, sind möglich und insbesondere bei Kindern häufig.

Verfahren

Nachweis von RNA/DNA

Indikation

Material

• Sputum
• Tracheo-/Bronchialsekret
• BAL

Methode

Lauris-
Auftragserteilung

PCR

PCR → Multiplex-PCR Respiratorische Pathogene → bei nosokomial erworbener Pneumonie

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Virale respiratorische Pathogene

• Adenovirus
• Coronavirus (NL63, 229E, OC43, HKU1)
• Humanes Metapneumovirus
• Humanes Rhinovirus/Enterovirus
• Influenza A Virus
• Influenza B Virus
• Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV)
• Parainfluenzavirus (1, 2, 3, 4)
• Respiratorisches Synzytialvirus (RSV A, B)

Bakterielle respiratorische Pathogene

• Acinetobacter calcoaceticus-baumanii complex
• Chlamydia pneumoniae
• Enterobacter cloacae
• Escherichia coli
• Haemophilus influenzae
• Klebsiella aerogenes
• Klebsiella oxytoca
• Klebsiella pneumoniae Gruppe
• Legionella pneumophila
• Moraxella catarrhalis
• Mycoplasmoides pneumoniae
• Proteus mirabilis
• Pseudomonas aeruginosa
• Serratia marcescens
• Staphylococcus aureus
• Streptococcus agalactiae
• Streptococcus pneumoniae
• Streptococcus pyogenes

Resistenz-Gene

• ESBL-Resistenz (CTX-M)
• Carbapenemasen (IMP, KPC, NDM, Oxa-48-ähnlich, VIM)
• Methicillin-Resistenz (mecA/mecC, MREJ)

Die Beurteilung der ätiologischen Relevanz, insbesondere bei Nachweis mehrerer Erreger, ist in Zusammenschau mit klinischen und paraklinischen Parametern zu treffen.

Besiedlungen ohne Indikation für eine Therapie, z. B. mit  Pneumokokken- und/oder Haemophilus influenzae-Isolaten, sind möglich und insbesondere bei Kindern häufig.

Verfahren

Nachweis von DNA

Indikation

Sexuell übertragbare Infektionen des Urogenitaltrakts

Material

• Urin
• Abstriche (Cervix uteri, Urethra)

Methode

Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren

Lauris-
Auftragserteilung

PCR

PCR/allgemeine Auftragsinformation → Multiplex-PCR STD (Sexually Transmitted Disease)

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Bakterien

• Chlamydia trachomatis
• Mycoplasma genitalium
• Mycoplasma hominis
• Neisseria gonorrhoeae
• Ureaplasma parvum
• Ureaplasma urealyticum

Parasiten

• Trichomonas vaginalis

Verfahren

Nachweis von RNA/DNA

Indikation

Ambulant erworbene Meningitis/Enzephalitis

Material

Liquor

Methode

Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren

Lauris-
Auftragserteilung

PCR

PCR/allgemeine Auftragsinformation → Multiplex-PCR ZNS (ambulant erworben)

Weiterführende Informationen

Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden:

Virale Pathogene

• Enterovirus
• Herpes simplex Virus 1 (HSV-1)
• Herpes simplex Virus 2 (HSV-2)
• Humanes Herpesvirus 6 (HHV-6)
• Humanes Parechovirus
• Varizella Zoster Virus (VZV)
• Zytomegalievirus (CMV)

Bakterielle Pathogene

• Escherichia coli K1
• Haemophilus influenzae
• Listeria monocytogenes
• Neisseria meningitidis
• Streptococcus agalactiae
• Streptococcus pneumoniae

Pilz-Pathogene

• Cryptococcus neoformans / gattii

x

Bearbeitung der Materialien bei Probeneingang bis 18:00 Uhr
(die Bearbeitungszeiten variieren methodenbedingt zwischen 0,5 h bis 28 d)

x¹

Bearbeitung der Materialien bei Probeneingang bis 10:30 Uhr
(die Bearbeitungszeiten variieren methodenbedingt zwischen 0,5 h bis 28 d)

x²

sofortige Bearbeitung nur bei Augenabstrichen (Keratokonjunktivitis epidemica), sonst am Folgetag

x³

sofortige Bearbeitung der HIV-Serologie im Rahmen von Nadelstichverletzungen (NSV)

A.-Abstr.

Analabstriche

Abstr.

Abstriche

AWM

Atemwegsmaterialien

BAL

Bronchioalveoläre Lavage

EDTA-Bl.

EDTA-Blut

Gew.

Gewebe

Li.

Liquor

Nagelgesch.

Nagelgeschabsel

Pkt.

Punktate

Ser.

Serum

Stu.

Stuhl

Ur.

Urin

AG

Antigennachweis

AK

Antikörpernachweis

Kultur

Kulturnachweis

PCR

Polymerasekettenreaktion

Seq

Sequenz