Erreger - Einsenderhinweise IMIKRO

Übersicht Respiratorische Pathogene

Respiratorische Pathogene oberer Atemwegsinfektionen

Ambulant erworbene Erreger

Verfahren	Nachweis von RNA/DNA
Indikation	Respiratorische Infektionen durch ambulant erworbene Erreger, v. a. die oberen Atemwege betreffend
Material	Nasen-, Rachenabstrich Sputum Tracheo-/Bronchialsekrete, BAL
Methode	Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren
Lauris- Auftragserteilung	PCR PCR → PCR → Multiplex-PCR Respiratorische Pathogene → bei ambulant erworbener Pneumonie
Weiterführende Informationen	Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden: Virale respiratorische Pathogene Adenovirus Bocavirus Coronavirus (NL63, 229E, OC43) Enterovirus Humanes Metapneumovirus Humanes Rhinovirus Influenza A Virus (H1, H1pdm09, H3) Influenza B Virus Parainfluenzavirus (1, 2, 3, 4) Respiratorisches Synzytialvirus (RSV A, B) Bakterielle respiratorische Pathogene Bordetella parapertussis Bordetella pertussis Chlamydia pneumoniae Legionella pneumophila Haemophilus influenzae Mycoplasmoides pneumoniae Streptococcus pneumoniae Die Beurteilung der ätiologischen Relevanz, insbesondere bei Nachweis mehrerer Erreger, ist in Zusammenschau mit klinischen und paraklinischen Parametern zu treffen. Besiedlungen ohne Indikation für eine Therapie, z. B. mit Pneumokokken- und/oder *Haemophilus influenzae*-Isolaten, sind möglich und insbesondere bei Kindern häufig.

Stand: Februar 2023

Respiratorische Pathogene oberer Atemwegsinfektionen (ambulant erworbene Erreger)

Respiratorische_Pathogene_Multiplex_ambulant.pdf

Respiratorische Pathogene tieferAtemwegsinfektionen

Ambulant und nosokomial erworbene Erreger

Verfahren	Nachweis von RNA/DNA
Indikation	Respiratorische Infektionen durch ambulant und nosokomial erworbene Erreger, v. a. die unteren Atemwege betreffend
Material	Sputum Tracheo-/Bronchialsekret BAL
Methode	Qualitativer Nukleinsäure-Nachweis im Multiplex-Format im Real-Time-PCR-Verfahren
Lauris- Auftragserteilung	PCR PCR → Multiplex-PCR Respiratorische Pathogene → bei nosokomial erworbener Pneumonie
Weiterführende Informationen	Folgende Erreger können in der Multiplex-PCR nachgewiesen werden: Virale respiratorische Pathogene Adenovirus Coronavirus (NL63, 229E, OC43, HKU1) Humanes Metapneumovirus Humanes Rhinovirus/Enterovirus Influenza A Virus Influenza B Virus Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) Parainfluenzavirus (1, 2, 3, 4) Respiratorisches Synzytialvirus (RSV A, B) Bakterielle respiratorische Pathogene *Acinetobacter calcoaceticus-baumanii complex* *Chlamydia pneumoniae* *Enterobacter cloacae* *Escherichia coli* *Haemophilus influenzae* *Klebsiella aerogenes* *Klebsiella oxytoca* *Klebsiella pneumoniae* Gruppe *Legionella pneumophila* *Moraxella catarrhalis* *Mycoplasmoides pneumoniae* *Proteus mirabilis* *Pseudomonas aeruginosa* *Serratia marcescens* *Staphylococcus aureus* *Streptococcus agalactiae* *Streptococcus pneumoniae* *Streptococcus pyogenes* Resistenz-Gene ESBL-Resistenz (CTX-M) Carbapenemasen (IMP, KPC, NDM, Oxa-48-ähnlich, VIM) Methicillin-Resistenz (mecA/mecC, MREJ) Die Beurteilung der ätiologischen Relevanz, insbesondere bei Nachweis mehrerer Erreger, ist in Zusammenschau mit klinischen und paraklinischen Parametern zu treffen. Besiedlungen ohne Indikation für eine Therapie, z. B. mit Pneumokokken- und/oder *Haemophilus influenzae*-Isolaten, sind möglich und insbesondere bei Kindern häufig.

Stand: Februar 2023

Respiratorische Pathogene tiefer Atemwegsinfektionen (ambulant und nosokomial erworbene Erreger)

Respiratorische_Pathogene_Multiplex_nosokomial.pdf

Ungezielte, allgemeine Anforderungen

(Auszug zeitliches Bearbeitungsschema IMIKRO)

Erreger	Nachweisart	Geeignete Materialien	Mo.	Di.	Mi.	Do.	Fr.	Sa.	So.
Bakterien aerob (E+R) + ggf. Antibiogramm	Kultur	siehe "mögliche Materialien"	x	x	x	x	x	x¹	x¹
Bakterien aerob + anaerob (E+R) + ggf. Antibiogramm	Kultur	siehe "mögliche Materialien"	x	x	x	x	x	x¹	x¹
Bakterien Gastroenteritis	Kultur	Stu.	x	x	x	x	x	x¹	x¹
Multiplex-PCR Gastroenteritis Bakterien	PCR	Stu.	x	x	x	x	x		x¹
Multiplex-PCR Gastroenteritis Viren	PCR	Stu.	x	x	x	x	x		x¹
Multiplex-PCR Herpesviren 1-6 (Herpes Consensus)	PCR	EDTA-Bl., AWM, Li., Gew., Abstr., Ur.	x	x	x	x	x		x¹
Multiplex-PCR Meningitis/Enzephalitis (ambulant erworben)	PCR	Li.	x	x	x	x	x	x	x
Multiplex-PCR Respiratorische Pathogene	PCR	AWM	x	x	x	x	x	x¹
Multiplex-PCR Sepsis	PCR	Blutkultur	x	x	x	x	x	x¹	x¹
Multiplex-PCR STD (Sexually Transmitted Disease)	PCR	Ur., Abstr.		x		x
Pilze + ggf. Antimykogramm	Kultur	siehe "mögliche Materialien"	x	x	x	x	x	x¹	x¹
Universelle PCR Bakterien (16S-rDNA-PCR)	PCR/Seq.	alle primär sterilen Materialien		x		x
Universelle PCR Pilze (18S-rDNA-PCR)	PCR/Seq.	alle Materialien (außer Stu.)		x		x

Stand: April 2022

Legende

Erklärung Symbole Wochentage

Symbol	Erklärung
x	Bearbeitung der Materialien bei Probeneingang bis 18:00 Uhr (die Bearbeitungszeiten variieren methodenbedingt zwischen 0,5 h bis 28 d)
x¹	Bearbeitung der Materialien bei Probeneingang bis 10:30 Uhr (die Bearbeitungszeiten variieren methodenbedingt zwischen 0,5 h bis 28 d)
x²	sofortige Bearbeitung nur bei Augenabstrichen (Keratokonjunktivitis epidemica), sonst am Folgetag
x³	sofortige Bearbeitung der HIV-Serologie im Rahmen von Nadelstichverletzungen (NSV)

Geeignete Materialien

Abkürzungen	Erklärung
A.-Abstr.	Analabstriche
Abstr.	Abstriche
AWM	Atemwegsmaterialien
BAL	Bronchioalveoläre Lavage
EDTA-Bl.	EDTA-Blut
Gew.	Gewebe
Li.	Liquor
Nagelgesch.	Nagelgeschabsel
Pkt.	Punktate
Ser.	Serum
Stu.	Stuhl
Ur.	Urin

Mögliche Materialien

Atemwege (AWM)

Brochialsekret
Brocheoalveoläre Lavage (BAL)
Mundspülwasser
Pleurapunktat
Sputum
Tracealsekret
sonstige Atemwegssekrete

Auge

Abstrich
Glaskörperpunktat
Vorderkammerpunktat
sonstige Materialien

Medizinprodukte/Fremdkörper

Drainage
Drainspitze
Katheterspitze
Stent
sonstige Materialien

Haut/Hautanhang

Abstrich
Haut
Haare
Hautgeschabsel
Nagelgeschabsel
Wundabstrich
sonstige Materialien

Herz/Kreislauf

Blutkultur (peripher)
Blutkultur (zentral)
EDTA-Blut
Herzklappe
Knochenmark
Serum
sonstige Materialien

Hals-Nasen-Ohren (HNO)

Abstrich Mundhöhle
Mundspülwasser
Nasenabstrich
Nasennebenhöhlenabstrich
Ohrabstrich
Rachenabstrich
Tonsillenabstrich
sonstige Materialien

Gastrointestinaltrakt

Anus praeter-Sekret
Aszitespunktat
Duodenalsaft
Galle
Intraabdominalabstrich
Magenbioptat
Schleimhaut-PE
Stuhlprobe
sonstige Materialien

Knochen/Gelenke

Bioptat/Gewebe
Gelenkspunktat
Knochenpunktat
Tiefer Abstrich
Wirbelsäule
sonstige Materialien

Urogenitaltrakt

Blasenpunktionsurin
Dauerkatheterurin
Einmalkatheterurin
Erststrahlurin
Klebebeutelurin
Mittelstrahlurin
Fistelurin
PCN-Urin
Anusabstrich
Rektumabstrich
Cavum uteri Abstrich
Cervixabstrich
Ejakulat
Glas Penis Abstrich
Urethraabstrich
sonstige Materialien

Zentrales Nervensystem (ZNS)

Bioptat/Gewebe
Liquor
Liquor in BK-Medium
sonstige Materialien

"Sonstige Materialien" bitte nur nach Rücksprache mit den verantwortlichen akademischen Mitarbeitern annehmen bzw. zur Einsendung zulassen.

Nachweisart

Kürzel
AG	Antigennachweis
AK	Antikörpernachweis
Kultur	Kulturnachweis
PCR	Polymerasekettenreaktion
Seq	Sequenz

Hinweis Versand

In obiger Liste nicht aufgeführte Untersuchungsgänge können nach telefonischer Absprache an ausführende Laboratorien verschickt werden.

Formular Allgemeiner Untersuchungsschein

(Auszug Formulare der Routinediagnostik IMIKRO)

Allgemeiner Untersuchungsauftrag (E+R)
Screening Nachweise
Serologische Nachweise (z. B. Nadelstichverletzung)
Universelle PCR-Nachweise
Multiplex-PCR-Nachweise
Untersuchungsauftrag Pilze

Allgemeiner Untersuchungsschein

Allgemeiner Untersuchungsschein (Bakterien/Parasiten/Pilze/Viren)

Stand: 01/2024

IMIKRO_AllgemeinerUntersuchungsschein.pdf

Formular Erregerspezifischer Untersuchungsschein